Картографування історичних даних герпетології і QGIS (Міссурі, США)¶
Місурійський атлас герпетології (Missouri Herpetological Atlas Project, MOHAP) було створено у 1997 р. як результат бажання створити та легко оновлювати карти розповсюдження амфібій та рептилій в Міссурі (США). Для зберігання наявних місць зустрічі та відомостей з історичних джерел і музейних записів було створено базу даних. З використанням бази даних можна створити набір карт, що показують як розповсюдження так і історію кожного виду.
Сайт MOHAP — http://atlas.moherp.org/ — містить інформацію про проект та різноманітні карти, створені в QGIS. Періодично випускається атлас в форматі PDF, також він публікується з метою забезпечити відкритий доступ до даних наукових досліджень (Daniel, R.E. and B.S. Edmond. 2012. Atlas of Missouri Amphibians and Reptiles for 2011. <http://atlas.moherp.org/pubs/atlas11.pdf>). Опубліковані карти використовуються біологами, землевпорядниками та іншими користувачами, які хочуть краще зрозуміти розповсюдження видів у Міссурі.
На лютий 2013 р. база даних MOHAP містила 31495 записів, які відповідають зразкам, розміщеним у 34 музейних колекціях, наведеним у 32 історичних джерелах; 5118 задокументованих записи, 6884 унікальних місць; та 12866 унікальних комбінацій вид / місце. У штаті нараховується 113 видів герпетофауни.
Генерація та експорт статичних карт¶
Процес створення карт в QGIS починається з завантаження даних з просторової бази даних PostgreSQL/PostGIS. Оскільки карти статичні та призначені як для розміщення в інтернеті, так і для публікації в складі атласу, вони генеруються для кожного виду автоматично за допомогою спеціального плаґіна (мал. 1 та 2)
Інтерфейс генерації та експорту карт, карти генеруються та експортуються в пакетному режимі¶
Отримані карти виглядають професійно (малюнок 3). Для наочної візуалізації розподілу видів створюється також серія базових карт з підписами (малюнок 4). Завдяки правильному налаштуванню стилів у кожному шарі даних, базові шари можуть легко інтегруватися з ними.
Згенеровані карти¶
Підписана карта Міссурі та прилеглих штатів¶
Підсумки¶
На початку роботи над MOHAP для зберігання та обробки даних використовувалось декілька комерційних та власницьких інструментів. Починаючи з 2007 р. ми вирішили перевести проект на використання вільного програмного забезпечення. QGIS, разом з PHP, PostgreSQL, PostGIS, Python, та ReportLab, сформували стрижень MOHAP та дозволили повністю відмовитися від власницького програмного забезпечення.
QGIS підтримує роботу з PostgreSQL та дозволяє створювати власні плаґіни на Python, які були необхідні для автоматичної генерації карт. Розгорнута документація дозволила нам дуже швидко автоматизувати процеси. Підтримка співтовариства також знаходиться на високому рівні, сюди ж можна віднести й наявність великої кількості плаґінів.
Хоча ми використовуємо QGIS для вирішення маленької та специфічної задачі, її можливості та підтримка плаґінів дозволяють вирішувати набагато складніші задачі.
Автор¶
Brian Edmond¶
Brian Edmond надіслав цю статтю у лютому 2013 р. Він працює старшим системним аналітиком в університеті Міссурі. Отримав ступінь бакалавра біології в університеті Міссурі та будує свою кар’єру на межі біології та технології.