Riserva forestale Amurum e mappatura dell’avifauna con QGIS in Nigeria¶
La riserva forestale Amurum si trova vicino alla città di Jos, Stato di Plateau, in Nigeria. È stata istituita in concomitanza con l’avvio della AP Leventis Ornitologico Research Institute (APLORI) ai fini della conservazione, l’istruzione e la ricerca della natura. APLORI è ospitato dal Dipartimento di Zoologia presso l’Università di Jos. Ogni anno un gruppo di circa otto studenti altamente motivati, provenienti da tutta la Nigeria, fanno una formazione sulla biologia della conservazione, sulla statistica (con R), e dal 2011 anche su GIS. Nel corso di due settimane in dicembre 2011 abbiamo studiato i concetti GIS di base e applicata con QGIS per gli studi sulla conservazione. In questo articolo descriviamo il modo in cui abbiamo usato QGIS per mappare gli habitat e i suoi determinanti della riserva Amurum e come le mappe di base dell’habitat sono state utilizzate per ottenere strati al fine di determinare in modo efficiente la distribuzione spaziale della avifauna tra cui la biodiversità.
Gruppo del corso¶
Mappatura dell’elevazione, sfumatura del terreno, pendenza e habitat¶
Mappatura dell’elevazione e classificazione del terreno: Abbiamo scaricato (gratuitamente) i dati di elevazione provenienti dal radar della NASA Shuttle Radar Topographic Mission (SRTM) per la zona in cui si trova Amurum. (le Informazioni sul set di dati di elevazione globale possono essere trovate qui: http://www.cgiar-csi.org/data/elevation/item/45-srtm-90m-digital-elevation-database-v41).
I GdalTools sono stati usati per fondere set di dati originali e per ritagliare una piccola area che contiene la riserva in modo che i dati raster siano ritagliati in quella zona. Per mezzo di GPS abbiamo raccolto elevazioni, in varie zone della riserva.
Nel complesso, le elevazioni del set di dati SRTM corrispondevano bene alle elevazioni raccolte con gps. I Modelli di terreno in GdalTools sono stati usati per calcolare le colline e piste per la zona. Queste variabili sono importanti da un punto di vista ecologico, perché sono fortemente associati con il tipo di habitat.
QGIS¶
Dal momento che abbiamo intenzione di sviluppare una bella mappa, abbiamo interpolato l’originale (ritagliato) elevazione della mappa per ottenere una risoluzione più elevata mappa. Abbiamo usato lo strumento altera in GdalTools. Mediante lo strumento di contorno abbiamo ottenuto linee di contorno lisce.
Le coordinate del confine della riserva sono state ottenuti camminando lungo i confini della riserva con un GPS. I punti d’interesse e le tracce memorizzate in GPS sono state importate utilizzando gli strumenti GPS, per costruire un shapefile di tipo poligono. I sentieri all’interno della riserva sono stati mappati in modo simile.
Siamo stati in grado di costruire rapidamente e con precisione una mappa dell’habitat di Amurum utilizzando un’immagine satellitare di Google che abbiamo ottenuto con il plugin Openlayers. La riserva ha tre tipi di habitat distinti: Savannah, Gallery forest e Rocky outcrop. Sulla base dell’immagine satellite abbiamo usato l’editor per disegnare i poligoni che delimitano i tre habitat. Le impostazioni delle opzioni di snap hanno permesso di costruire correttamente poligoni non sovrapposti.
Mappatura della distribuzione degli uccelli e diversità¶
Le mappe degli habitat sono state usate per generare posizioni casuali. L’area dei vari tipi di habitat sono stati usati per generare un numero di posizioni proporzionale alla superficie di ciascun tipo di habitat (stratificazione).
Gruppo del corso¶
I punti casuali in fTools sono stati usati per questo scopo. Tutti i luoghi sono stati visitati nel corso di due mattinate di quattro gruppi di studenti (due per gruppo) per un totale di 38 posizioni casuali sparsi in tutta la riserva. I dati di osservazione sono stati inseriti in un foglio di calcolo e analizzati utilizzando R. Inoltre è stato calcolato l’indice di diversità di Shannon-Wiener, utilizzando R. Dopo la fusione con il file posizione con i dati di osservazione risultante, è stato esportato come file CSV che è stato caricato in QGIS usando funzione «Aggiungi layer di testo delimitato». Sulla base degli strati di cui sopra la mappa è stata costruita presentando alcune delle più importanti caratteristiche del paesaggio e diversità aviaria della riserva Amurum.
In conclusione¶
Nel complesso, il corso è stato un grande successo. Noi - un gruppo di studenti con nessuna esperienza precedente GIS — abbiamo apprezzato molto il lavoro con QGIS. In due settimane di tempo siamo stati in grado di sviluppare una mappa estremamente utile della riserva. Tra gli altri, le estensioni dei vari habitat consentono una migliore stratificazione e quindi per una previsione delle abbondanze di vari tipi di organismi. In fondo siamo ora in grado di fare meglio della ricerca ecologica utilizzando QGIS come una piattaforma open source.
Mappa con QGIS: divesrità della Amurum Forest Reserve¶